Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALDH1A2O94788 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH1A2O94788 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms