Protein–RNA interactions for Protein: O75874

IDH1, Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH1O75874 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IDH1O75874 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IDH1O75874 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IDH1O75874 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IDH1O75874 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IDH1O75874 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IDH1O75874 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
IDH1O75874 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IDH1O75874 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IDH1O75874 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IDH1O75874 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
IDH1O75874 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
IDH1O75874 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IDH1O75874 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IDH1O75874 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IDH1O75874 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IDH1O75874 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
IDH1O75874 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IDH1O75874 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IDH1O75874 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IDH1O75874 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IDH1O75874 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IDH1O75874 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IDH1O75874 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IDH1O75874 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IDH1O75874 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IDH1O75874 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IDH1O75874 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IDH1O75874 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IDH1O75874 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IDH1O75874 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IDH1O75874 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IDH1O75874 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IDH1O75874 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
IDH1O75874 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IDH1O75874 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IDH1O75874 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IDH1O75874 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IDH1O75874 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IDH1O75874 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IDH1O75874 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IDH1O75874 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IDH1O75874 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IDH1O75874 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IDH1O75874 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IDH1O75874 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IDH1O75874 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IDH1O75874 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IDH1O75874 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IDH1O75874 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IDH1O75874 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IDH1O75874 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IDH1O75874 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IDH1O75874 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IDH1O75874 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IDH1O75874 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IDH1O75874 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IDH1O75874 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IDH1O75874 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IDH1O75874 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IDH1O75874 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IDH1O75874 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IDH1O75874 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IDH1O75874 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IDH1O75874 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IDH1O75874 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IDH1O75874 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IDH1O75874 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IDH1O75874 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IDH1O75874 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IDH1O75874 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IDH1O75874 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IDH1O75874 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IDH1O75874 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms