Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM1O75626 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM1O75626 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms