Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BANF1O75531 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BANF1O75531 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BANF1O75531 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BANF1O75531 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BANF1O75531 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BANF1O75531 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BANF1O75531 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BANF1O75531 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BANF1O75531 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BANF1O75531 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BANF1O75531 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BANF1O75531 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BANF1O75531 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BANF1O75531 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BANF1O75531 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BANF1O75531 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BANF1O75531 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BANF1O75531 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BANF1O75531 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BANF1O75531 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BANF1O75531 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BANF1O75531 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BANF1O75531 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BANF1O75531 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BANF1O75531 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BANF1O75531 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BANF1O75531 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BANF1O75531 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BANF1O75531 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BANF1O75531 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BANF1O75531 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BANF1O75531 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BANF1O75531 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BANF1O75531 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BANF1O75531 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BANF1O75531 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BANF1O75531 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BANF1O75531 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BANF1O75531 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BANF1O75531 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BANF1O75531 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BANF1O75531 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BANF1O75531 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BANF1O75531 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BANF1O75531 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BANF1O75531 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BANF1O75531 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BANF1O75531 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BANF1O75531 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BANF1O75531 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BANF1O75531 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BANF1O75531 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BANF1O75531 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms