Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF40O75150 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF40O75150 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF40O75150 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF40O75150 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF40O75150 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF40O75150 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF40O75150 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF40O75150 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF40O75150 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF40O75150 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF40O75150 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF40O75150 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF40O75150 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF40O75150 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF40O75150 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF40O75150 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF40O75150 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF40O75150 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF40O75150 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF40O75150 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF40O75150 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF40O75150 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF40O75150 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF40O75150 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF40O75150 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF40O75150 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF40O75150 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF40O75150 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF40O75150 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF40O75150 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF40O75150 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF40O75150 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF40O75150 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF40O75150 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF40O75150 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF40O75150 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF40O75150 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF40O75150 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF40O75150 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF40O75150 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF40O75150 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF40O75150 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF40O75150 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF40O75150 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF40O75150 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF40O75150 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF40O75150 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF40O75150 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF40O75150 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF40O75150 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF40O75150 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF40O75150 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF40O75150 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF40O75150 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF40O75150 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF40O75150 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF40O75150 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF40O75150 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF40O75150 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF40O75150 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF40O75150 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF40O75150 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF40O75150 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF40O75150 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF40O75150 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF40O75150 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF40O75150 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF40O75150 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms