Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SHANK2-217ENST00000498519 510 ntTSL 313.08□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 26.8
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PRPF4O43172 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-7■■■■□ 26.7
PRPF4O43172 NCKIPSD-203ENST00000415281 803 ntTSL 311.71□□□□□ -0.531e-7■■■■□ 26.7
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PRPF4O43172 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.932e-7■■■■□ 26.7
PRPF4O43172 FASTK-205ENST00000461979 720 ntTSL 520.32■□□□□ 0.842e-7■■■■□ 26.7
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PRPF4O43172 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 26.7
PRPF4O43172 FASTK-204ENST00000460980 1521 ntTSL 515.66■□□□□ 0.12e-7■■■■□ 26.7
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PRPF4O43172 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-8■■■■□ 26.6
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PRPF4O43172 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)8.48□□□□□ -1.058e-7■■■■□ 26.5
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PRPF4O43172 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.165e-59■■■■□ 26.5
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PRPF4O43172 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-8■■■■□ 26.5
PRPF4O43172 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.36■□□□□ 0.372e-8■■■■□ 26.5
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PRPF4O43172 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.022e-8■■■■□ 26.5
PRPF4O43172 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.242e-8■■■■□ 26.5
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PRPF4O43172 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.029e-9■■■■□ 26.5
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PRPF4O43172 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.215e-10■■■■□ 26.5
PRPF4O43172 TEAD4-205ENST00000536826 570 ntTSL 416.22■□□□□ 0.195e-10■■■■□ 26.5
PRPF4O43172 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.055e-10■■■■□ 26.5
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