Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF646O15015 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF646O15015 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF646O15015 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF646O15015 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF646O15015 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF646O15015 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF646O15015 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF646O15015 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF646O15015 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF646O15015 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF646O15015 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF646O15015 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF646O15015 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF646O15015 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF646O15015 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF646O15015 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF646O15015 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF646O15015 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF646O15015 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF646O15015 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF646O15015 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF646O15015 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF646O15015 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZNF646O15015 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF646O15015 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF646O15015 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF646O15015 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF646O15015 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF646O15015 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF646O15015 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF646O15015 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF646O15015 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF646O15015 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF646O15015 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF646O15015 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF646O15015 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZNF646O15015 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF646O15015 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF646O15015 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF646O15015 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF646O15015 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF646O15015 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF646O15015 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF646O15015 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF646O15015 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF646O15015 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms