Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APAF1O14727 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APAF1O14727 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APAF1O14727 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APAF1O14727 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APAF1O14727 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APAF1O14727 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APAF1O14727 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APAF1O14727 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APAF1O14727 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APAF1O14727 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APAF1O14727 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APAF1O14727 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APAF1O14727 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APAF1O14727 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APAF1O14727 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APAF1O14727 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APAF1O14727 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APAF1O14727 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APAF1O14727 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APAF1O14727 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APAF1O14727 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APAF1O14727 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APAF1O14727 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APAF1O14727 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APAF1O14727 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APAF1O14727 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APAF1O14727 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APAF1O14727 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APAF1O14727 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APAF1O14727 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APAF1O14727 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
APAF1O14727 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
APAF1O14727 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APAF1O14727 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APAF1O14727 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APAF1O14727 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APAF1O14727 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APAF1O14727 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APAF1O14727 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APAF1O14727 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APAF1O14727 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APAF1O14727 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APAF1O14727 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APAF1O14727 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APAF1O14727 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APAF1O14727 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APAF1O14727 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APAF1O14727 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APAF1O14727 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APAF1O14727 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APAF1O14727 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APAF1O14727 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APAF1O14727 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APAF1O14727 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APAF1O14727 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APAF1O14727 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APAF1O14727 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APAF1O14727 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APAF1O14727 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
APAF1O14727 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
APAF1O14727 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
APAF1O14727 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
APAF1O14727 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
APAF1O14727 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APAF1O14727 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms