Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTDSP2O14595 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSP2O14595 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms