Protein–RNA interactions for Protein: O00231

PSMD11, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD11O00231 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD11O00231 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMD11O00231 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD11O00231 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms