Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBXN8O00124 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN8O00124 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms