Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM22K7EJ46 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM22K7EJ46 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMIM22K7EJ46 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms