Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
J3QR89 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
J3QR89 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QR89 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QR89 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QR89 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QR89 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QR89 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QR89 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QR89 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QR89 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QR89 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QR89 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QR89 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QR89 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QR89 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QR89 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QR89 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QR89 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QR89 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QR89 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QR89 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms