Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQV1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQV1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQV1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQV1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQV1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BQV1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H3BQV1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H3BQV1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H3BQV1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
H3BQV1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQV1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQV1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQV1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQV1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQV1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQV1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQV1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQV1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BQV1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQV1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQV1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQV1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQV1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQV1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQV1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQV1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BQV1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
H3BQV1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
H3BQV1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BQV1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BQV1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BQV1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BQV1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BQV1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BQV1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BQV1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BQV1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BQV1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BQV1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BQV1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BQV1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BQV1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BQV1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BQV1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BQV1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BQV1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BQV1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BQV1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQV1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQV1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQV1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQV1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQV1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQV1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQV1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQV1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BQV1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BQV1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BQV1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BQV1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BQV1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BQV1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BQV1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BQV1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
H3BQV1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
H3BQV1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms