Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E9PQ18 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E9PQ18 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E9PQ18 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E9PQ18 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E9PQ18 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E9PQ18 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E9PQ18 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E9PQ18 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E9PQ18 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
E9PQ18 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E9PQ18 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E9PQ18 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E9PQ18 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
E9PQ18 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
E9PQ18 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
E9PQ18 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
E9PQ18 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E9PQ18 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E9PQ18 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
E9PQ18 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
E9PQ18 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E9PQ18 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E9PQ18 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms