Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf172C9J069 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf172C9J069 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf172C9J069 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms