Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL13PA6NNM8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL13PA6NNM8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms