Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMIM23A6NLE4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms