Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERINC4A6NH21 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SERINC4A6NH21 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms