Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCAF2A6NFQ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCAF2A6NFQ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCAF2A6NFQ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms