Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN11A1L157 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms