Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQC6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQC6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PQC6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A1W2PQC6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PQC6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms