Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WZ39

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WZ39 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WZ39 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WZ39 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A087WZ39 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A087WZ39 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WZ39 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WZ39 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WZ39 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WZ39 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WZ39 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WZ39 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A087WZ39 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms