Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PALD1Q9ULE6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms