Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LHX3Q9UBR4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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LHX3Q9UBR4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LHX3Q9UBR4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LHX3Q9UBR4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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