Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KLHL13Q9P2N7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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KLHL13Q9P2N7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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KLHL13Q9P2N7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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KLHL13Q9P2N7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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KLHL13Q9P2N7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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KLHL13Q9P2N7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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KLHL13Q9P2N7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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KLHL13Q9P2N7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLHL13Q9P2N7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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