Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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CNTN3Q9P232 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CNTN3Q9P232 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTN3Q9P232 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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