Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SERINC1Q9NRX5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms