Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CIPCQ9C0C6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms