Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms