Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD3Q96L08 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms