Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms