Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms