Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms