Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG16L1Q676U5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG16L1Q676U5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms