Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HSD17B12Q53GQ0 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms