Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DUSP6Q16828 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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