Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRKQ15262 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRKQ15262 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms