Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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ITGA7Q13683 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA7Q13683 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms