Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C1orf61Q13536 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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