Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms