Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP4Q13115 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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