Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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