Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SRSF4Q08170 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms