Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDR2Q01850 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms