Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms