Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms