Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC239868.3-201ENST00000577853 1234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSEN1P49768 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms