Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTAP49354 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms