Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPD2P43304 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPD2P43304 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms